细胞在组织器官内所处的空间位置对于它发挥特异性功能至关重要，为了突破现有空间转录组学技术在分辨率和通量上的局限性，生物信息学家设计了多种算法来整合空间转录组与单细胞转录组数据，但不同算法的工作原理和适用范围存在显著差异，使得研究者很难选择最佳算法用来预测细胞类型和基因表达的空间分布。中国科大科研人员通过设计一整套分析流程，从准确性、鲁棒性、计算资源耗时等多维度，系统性地评估了16种空间转录组和单细胞转录组数据整合算法在预测基因或细胞类型空间分布方面的性能，并在开源软件平台github上提供了该流程，以帮助研究人员选择最佳分析工具，促进对相关生物学和病理过程的理解。相关成果发表在《自然方法》。